Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSSK4Q6SA08 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms