Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4L9Q6RFH8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms