Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LARP1Q6PKG0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LARP1Q6PKG0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms