Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1AQ6PJP8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1AQ6PJP8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms