Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC174Q6PII3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms