Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A1Q6PCB7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms