Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF40BQ6NWY9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms