Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPRIN2Q6IMN6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.7 ms