Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO4Q6EEV6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms