Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTC19Q6DKK2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms