Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms