Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40Q6AI12 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD40Q6AI12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms