Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPECC1LQ69YQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms