Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VIRMAQ69YN4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VIRMAQ69YN4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms