Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms