Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM29Q5VYK3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms