Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms