Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRIP1Q5VSL9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRIP1Q5VSL9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms