Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FRMPD1Q5SYB0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms