Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COLEC12Q5KU26 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms