Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KHDC3LQ587J8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms