Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HSD17B12Q53GQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HSD17B12Q53GQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms