Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL12Q53G59 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms