Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC1Q4ZHG4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms