Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDNFQ49AH0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms