Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF3Q496Y0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LONRF3Q496Y0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LONRF3Q496Y0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms