Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms