Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms