Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD55Q3KP44 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD55Q3KP44 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms