Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC27Q2M243 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC27Q2M243 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms