Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC142Q17RM4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC142Q17RM4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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