Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPROQ16827 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPROQ16827 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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