Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA3Q16787 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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