Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK4Q16654 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDK4Q16654 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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