Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECM1Q16610 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECM1Q16610 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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