Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms