Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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