Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85BQ15834 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms