Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITSN1Q15811 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITSN1Q15811 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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