Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNHIT3Q15649 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNHIT3Q15649 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms