Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3A1Q15459 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF3A1Q15459 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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