Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDK3Q15120 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDK3Q15120 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms