Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFIXQ14938 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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