Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMC1AQ14683 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC1AQ14683 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
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