Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CDK13Q14004 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CDK13Q14004 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CDK13Q14004 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
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