Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPSQ13938 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms