Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGA9Q13797 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGA9Q13797 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGA9Q13797 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ITGA9Q13797 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITGA9Q13797 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITGA9Q13797 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA9Q13797 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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