Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL4BQ13620 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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