Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PEX6Q13608 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PEX6Q13608 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX6Q13608 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PEX6Q13608 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX6Q13608 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PEX6Q13608 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PEX6Q13608 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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