Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SF3B2Q13435 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B2Q13435 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
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